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Este exame é útil na determinação do diagnóstico de gastrite atrófica e anemia perniciosa. A gastrite atrófica é uma alteração que afeta a mucosa corporal e quando associada com anemia perniciosa. É frequentemente considerada auto-imune, suportada pela presença de anticorpos anti células parietais (ACEPA) e anti factor intrínseco (AAFIN). Associações com outras doenças auto-imunes específicas de órgão são frequentes, nomeadamente doenças auto-imunes da tiróide. Gastrite auto-imune e anemia perniciosa são doenças auto-imunes comuns, com uma frequência respectiva de 2 e 0,1-1% na população em geral, aumentando com a idade. Em doentes com doença tiroideia auto-imune a prevalência é igualmente elevada. O ataque auto-imune às células parietais resulta em uma diminuição da secreção ácida, hipergastrinemia, anemia ferropénica e anemia perniciosa com défict de vitamina B12, conduzindo a um risco aumentado de desenvolvimento de cancro gástrico e tumores carcinóides. Desta forma, o diagnóstico precoce de gastrite atrófica auto-imune será relevante para tratar e prevenir a evolução destas situações.